El CIISSS surge con la expectativa de constitución en un centro de ejecución, y de fomento de la ejecución, de investigación interdisciplinaria sobre sexualidad, salud sexual y SIDA en el contexto social, abierto a toda la comunidad herediana, y proyectado a la sociedad. Genera y difunde evidencia científica para aportar a la mejora de las políticas públicas en un marco de derechos humanos. Aspira a convertirse en un centro de referencia local, regional y global.